Изначально для работы с файлами или же папками необходимо подключить сам модуль:

var fs = require('fs');

Для создания папки необходимо использовать метод mkdir(), а для удаления rmdir(). В качестве первого параметра необходимо передавать значение названия файла, а в качестве второго параметра функцию, которая должна сработать по завершению работы команды.

Если вы удаляете целую папку, то убедитесь что в ней нет никаких дополнительных файлов или же папок. Если таковы имеются, то изначально необходимо будет удалить именно их, а после этого саму папку. Для удаления файлов различного типа используйте метод unlink():

fs.unlink('./some_image.png', function() {});